Pese a los esfuerzos por rescatar los numerosos objetos religiosos, joyas de la Familia Real y cuadros que el Alcázar albergaba, se perdieron importantes obras pictóricas como «La expulsión de los moriscos» de Velázquez o «El rapto de las Sabinas» de Tiziano, así como colecciones de autores como Tintoretto, Veronés, El Greco o Leonardo da Vinci, entre muchos otros.