Que yo recuerde y así de la forma mas burda de contarlo, la onda corta usa la ionosfera como una especie de "Guia de onda". La ionoesfera forma parte de los "escudos del planeta". Si la ionosesfera esta mas "cargada" de lo normal esta haciendo su funcion de escudo que es muy intersante desde el punto de vista de al vida que vive en el planeta. Que se pierdan las comunicaciones temporalmente por que que la ionosfera pierda en esa region las propiedades de "guia de onda", es un problema, por ejemplo, para la navegacion actual, pero visto en prespectiva, pienso que parece no ser tanto problema. Sobre todo teniendo buena ingeniería para solventar esos "pequeños inconvenientes" de comunicacion.

es.wikipedia.org/wiki/Tormenta_geomagnética

Aquí hablan de una que hasta afectó la red eléctrica de Quebec, así que las hay bastante serias.